L'archivio della Curia arcivescovile di Otranto si è nel tempo strutturato in due distinte sezioni:

     
- 1a sezione    

E' costituita dagli atti relativi all'amministrazione generale della diocesi organizzati dalla Curia per tipologia documentale.

     
- 2a sezione    
E' costituita dal carteggio della Curia organizzato dalla stessa per "luoghi" della diocesi.